Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengetahui pengaruh DAU tahun berjalan, PAD tahun berjalan, DAU tahun sebelumnya dan PAD tahun sebelumnya terhadap Belanja Daerah tahun berjalan serta untuk melihat apakah terjadi flypaper effect pada Kabupaten/Kota di Yogyakarta. Data yang dianalisis dalam penelitian ini adalah data sekunder yang bersumber dari dokumen Laporan Realisasi APBD Kabupaten/Kota di tahun anggaran 2005-2011. Peneitian ini menggunakan model regresi data panel. Hasil analisis dalam penelitian ini menunjukkan bahwa Dana Alokasi Umum tahun berjalan dan Dana Alokasi Umum tahun sebelumnya berpengaruh positif terhadap belanja daerah tahun berjalan. Sedangkan Pendapatan Asli Daerah tahun berjalan dan Pendapatan Asli Daerah tahun sebelumnya tidak berpengaruh positif terhadap belanja daerah tahun berjalan. Secara bersama-sama, keempat variabel ini berpengaruh terhadap belanja daerah. Serta terjadi Flypaper Effect di Kota/Kabupaten di Yogyakarta.