Malaria burung merupakan penyakit yang berpotensi menurunkan jumlah
populasi burung. Malaria burung disebabkan oleh parasit dari Filum
Apicomplexa, terutama Plasmodium spp. dan Haemoproteus spp. yang
menginfeksi burung melalui perantaraan vektor serangga seperti nyamuk, biting
midges dan hippoboscid flies. Pantai Trisik digunakan sebagai tempat
persinggahan burung migran, sehingga dapat terjadi perpindahan parasit antara
burung lokal dan burung migran. Bondol Jawa (Lonchura leucogastroides) adalah
salah satu burung lokal yang hidup di pantai Trisik, memiliki habitat yang luas
seperti padang rumput, semak belukar dan persawahan sehingga rentan terhadap
infeksi parasit malaria burung. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi
dan mengetahui tingkat prevalensi malaria burung terhadap burung Bondol Jawa
(Lonchura leucogastroides) di pantai Trisik, Kulonprogo, Yogyakarta. Penelitian
ini dilakukan dalam beberapa tahapan yaitu penangkapan burung untuk
pengambilan sampel darah, analisis molekuler yang terdiri dari ekstraksi DNA
dengan metode Phenol Chloroform Extraction, amplifikasi DNA dengan metode
nested PCR, visualisasi DNA menggunakan elektroforesis gel agarosa dan analisis
data. Nested PCR menggunakan pasangan primer Haem NFI dan Haem NR3 pada
tahap pertama, dan pasangan primer Haem F dan Haem R2 pada tahap kedua.
Amplifikasi DNA lima sampel darah burung yang berhasil diekstraksi
menunjukkan bahwa satu sampel positif terinfeksi parasit malaria burung dan
tingkat prevalensi malaria burung Bondol Jawa (Lonchura leucogastroides)
adalah sebesar 20%.