Lactobacilli dan Bifidobacteria telah diketahui bermanfaat sebagai probiotik yang mampu meningkatkan kesehatan pencernaan inangya. Studi metabolisme dan karakterisasi telah banyak dilakukan, namun penelitian mengenai peranan Lactobacilli dan Bifidobacteria pada primata, khususnya yang terancam punah, masih terbatas. Orangutan (Pongo pygmaeus) merupakan primata yang terancam punah akibat perburuan dan kehilangan habitat. International Union for Conservation of Nature (IUCN) memprediksi pada tahun
2025 populasi orangutan akan berkurang hingga 82%. Salah satu kesulitan dalam
konservasi orangutan, khususnya pada anakan yang ditinggal mati induknya akibat perburuan, adalah depresi. Penelitian terbaru menemukan bahwa depresi bisa dipengaruhi oleh keberadaan Lactobacilli dan Bifidobacteria pada saluran pencemaan.
Berdasarkan permasalahan di atas, penelitian ini bertujuan untuk
mengetahui keragaman Lactobacilli dan Bifidobacteria pada usus P. pygmaeus.
Sebanyak 4 sampel feses P. pygmaeus dari Kebun Binatang Gembira Loka dikoleksi dan disimpan dalam etanol 95% pada suhu 4 C. Fragmen 16s rRNA yang diperoleh dari basil ekstraksi diamplifikasi menggunakan PCR dengan primer spesifik untuk bakteri dari genus Lactobacil/us dan Bifidobacterium, yaitu Lacto-lw forward [5'-GAACGCTGGCGGCGTGCCTCAT-3'], Lacto-2w reverse (5'-CAGGGTATCTAATCCTGTTCGGTa-3'], Bif-lw forward [5'• ACGGGTGAGTAATGCGTGACC-3'], dan Bif-4w reverse [5'• TGGTGTTCTTCCCGATATCTTCA-3'].
Tahapan PCR diawali dengan predenaturasi pada suhu 98C selama 5
menit. Tahap selanjutnya adalah amplifikasi sebanyak 40 siklus yang terdiri dari denaturasi (98C, 5 detik), annealing (60'C, 5 detik), dan ekstensi (72C, 25 detik). Ekstensi akhir dilakukan pada suhu 72C selama 1 menit. Hasil amplifikasi lalu
disekuensing, kemudian diidentifikasi menggunakan BLAST. Hasil identifikasi menunjukkan bahwa pada usus P. pygmaeus di Kebun Binatang Gembira Loka terdapat spesies L. johnsii, L. taiwanensis, B. angulatum, B. merycicum, dan B. dentium.