Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui faktor-faktor yang mempengaruhi nilai tukar Rupiah terhadap Yen Jepang. Adapun variabel yang digunakan dalam penelitian ini adalah nilai tukar riil, Produk Domestik Bruto (PDB), Jumlah Uang Beredar (JUB) dan tingkat Suku Bunga. Penelitian ini menggunakan periode pengamatan dari kuartal pertama tahun 1990 hingga kuartal ke empat tahun 2007 dengan menggunakan Model Koreksi Kesalahan (ECM). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa dalam jangka pendek hanya variabel nilai tukar rill yang signifikan dan perpengaruh terhadap nilai tukar Rupiah terhadap Yen Jepang. Dalam jangka panjang, semua variabel berpengaruh dan signifikan terhadap nilai tukar Rupiah terhadap Yen Jepang.