Ekstraksi DNA dapat memakan waktu dan biaya saat diterapkan dalam penelitian skala
besar, sehingga beberapa studi mengkaji tingkat keberhasilan amplifikasi menggunakan
metode isolasi DNA alternatif (tanpa ekstraksi). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui
metode isolasi DNA paling efektif untuk molecular sexing Cerek Jawa. Penelitian ini
menggunakan 5 sampel darah kertas saring, dan 8 sampel darah EDTA yang diisolasi
dengan metode kit ekstraksi DNA, lisis alkali dan PCR langsung. PCR untuk tujuan
molecular sexing dilakukan dengan menggunakan primer 2550F/2718R. Hasil penelitian
menunjukan bahwa DNA pada sampel darah kertas saring dan EDTA yang diisolasi baik
menggunakan kit ektraksi DNA, lisis alkali maupun PCR langsung, berhasil diamplifikasi
dengan primer 2550F/2718R yang menghasilkan pita CHD1-Z dengan ukuran 621 bp dan
pita CHD1-W dengan ukuran 459 bp, namun kualitas pita DNA yang dihasilkan berbeda.
Metode Isolasi DNA dengan kit ekstraksi menghasilkan DNA templat yang paling efektif
untuk molecular sexing Cerek Jawa karena pita DNA hasil amplifikasi lebih jelas dibanding
metode yang lain.