Masjid Kampus UGM merupakan wadah bagi aktivitas mahasiswa muslim Universitas Gadjah Mada. Dimana sistem aktivitas yang terdapat didalamnya tidak sama dengan sistem aktivitas yang ada di masjid-masjid kampung atau bahkan di masjid kampus yang lain.
Perbedaan sistem aktivitas ini akan menunjukkan identitas yang berbeda dari masjid kampus UGM ini. Sistem aktivitas yang terjadi dalam masjid kampus UGM ini adalah sistem aktivitas yang sifatnya multifungsi dan mencakup semua aspek kehidupan yang ada dan diatur dalam agama Islam, yaitu aspek vertikal (ibadah) dan aspek horizontal atau kegiatan yang sifatnya kegiatan sosial kemasyarakatan.
Sistem aktivitas yang bermacam ini akan dirangkum dalam satu wadah aktivitas mahasiswa muslim UGM yaitu dalam sebuah Masjid Kampus.