Passeriformes merupakan ordo yang memiliki tingkat keanekaragaman
tertinggi yaitu mencapai 59%(kurang lebih 5.300 sp) dari burung di dunia.
Penentuan jenis kelamin pada ordo Passeriformes cukup sulit dilakukan karena
kurang lebih 60% dari ordo ini merupakan monomorfik berdasarkan warna
bulunya. Tujuan penelitian ini untuk menentukan jenis kelamin pada individu dari
11 spesies yang termasuk dalam Passeriformes dan membandingkan efektivitas
yang dimiliki oleh 4 pasang primer dalam proses ampilifikasi PCR. Primer yang
digunakan yaitu P2/P8, 1237L/1272H, 2550F/2718R dan 2561/2728, yang
mengamplifikasi gen Chromo-helicase-DNA (CHD). Jumlah sampel yang
digunakan sebanyak 21 individu. Berdasarkan penelitian yang telah dilakukan,
didapatkan hasil yaitu keempat pasang primer secara positif mampu
mengamplifikasi CHD dengan individu betina sebanyak 10 dan jantan sebanyak
11 individu. Primer P2/P8, 2550F/2718R dan 2561 mampu mengmplifikasi 100%
sedan gkan 1237L/1272H 90,84%. Evaluasi efektivitas primer dilakukan dengan
menghitung jumlah pita yang terbentuk dari amplikon dan mengukur panjang
basa.Efektivitas primer P2/P8 dan 1237L/1272H 52,38% dan 47,62%. Kondisi
yang sama primer 2550F/2718R dan 2561/2728 memiliki efektivitas yang lebih
tinggi yaitu 90,84% dan 100%. Penentuan jenis kelamin molekuler dapat
mengidentifikasi jenis kelamin pada burung ordo Passeriformes di Indonesia serta
didapatkan sekuens gen CHDW dan CHDZ dari Cynirris jugularis dan Dicrurus
leucopaheusdengankomposisi A+T pada CHDWyaitu 64,13% dan 65,93%, sedan
gkan pada CHDZ yaitu 62,29% dan 61,44%.